ФНС России в своём письме от 10.10.2023 № СД-4-3/12950@ разъяснила, что по общему правилу организации и индивидуальные предприниматели, применяющие упрощенную систему налогообложения, не являющиеся плательщиками НДС: не обязаны выставлять счета-фактуры, платить налог и отчитываться по нему.
Однако если лицо, не являющиеся налогоплательщиком НДС, в том числе организации и индивидуальные предприниматели, перешедшие на упрощенную систему налогообложения, выставит покупателю счет-фактуру с выделенной суммой НДС, в отношении этой операции у него возникнет обязанность по уплате этого налога (п.5 ст.173 НК РФ).